辦理離職因培訓協議，被扣證件和離職證明，公司是否違法？

計算機軟硬件開發崗位，3個月試用期，1年輪崗期，5年合約。試用期間籤被迫訂一萬元培訓合同，不籤就要離職，合同中也明確將培訓作為員工考核定崗定薪晉升的依據。培訓聘請外部講師：初級軟件測試、java軟件開發、項目管理。培訓後，頒發了公司蓋得3項合格證書（行業內並不認可），仍然原系統開發崗位，待遇也沒變。現工作1年，提前半月申請離職。
問題1：辦理離職，公司是否有權利以不是附屬合同的'培訓為由拒絕辦理離職相關手續？
問題2：培訓協議是否存在違約？是否為被脅迫？培訓是否為專業技能培訓，或只是一般的崗前培訓？